ページ内に複数の広告がある場合には、広告コードの1行目にある<script>～</script>は1回で良いそうです。
非同期タグでしたので何も考えずに最後の方（</body>直前）に書いたのですが、どうやらそれが原因で広告が表示されたりされなかったりしていました。
プラグイン等の外部ファイルにAdSense表示部分が書かれている場合には、非同期での読み込みが間に合って表示されるようで、インラインで書かれている場合だけが不安定でした。
Nginx（Webサーバ）のFastCGI（キャッシュ）も影響していたようで、気が付くまでに時間がかかってしまいました。
<head>～</head>の間に記述して安定しました。
<head>
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<script src="https://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/3.3.1/jquery.min.js"></script>
<script async src="//pagead2.googlesyndication.com/pagead/js/adsbygoogle.js"></script>
</head>
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<ins class="adsbygoogle"
data-ad-client="ca-pub-XXXXXXXXXXXXXXXX"
data-ad-slot="XXXXXXXXXX"></ins>
<script>
(adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});
</script>
